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13位科學家呼吁對韓春雨啟動調(diào)查:為了中國學界名聲

2016年10月11日 09:38:09  來源:澎湃新聞網(wǎng)
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  河北科技大學副教授韓春雨。

  原標題:13位科學家實名呼吁對韓春雨啟動調(diào)查:為了中國學界的名聲

  這是一場和時間的賽跑。這場賽跑賭上的,是中國學術(shù)界在國際上的名聲。

  一切源于2016年5月2日,河北科技大學副教授韓春雨課題組在國際頂級期刊《自然-生物技術(shù)》上發(fā)表了NgAgo基因編輯技術(shù)的論文。剛發(fā)表時,NgAgo被認為是新一代基因編輯工具,可媲美此前有“基因魔剪”美稱的CRISPR技術(shù),被國內(nèi)部分媒體譽為“諾獎級”學術(shù)成果。 然而,之后的故事急轉(zhuǎn)直下,全球數(shù)百家實驗室,歷時5個月的時間,沒有一家宣布能重復成功。質(zhì)疑聲越來越大,韓春雨不作正面回應,卻收獲接連的榮譽:河北科協(xié)副主席、美麗河北最美教師、100萬元國家自然科學基金……受惠于NgAgo技術(shù),河北科大獲得了河北發(fā)改委2.24億元的財政撥款,用于建設(shè)河北科技大學基因編輯技術(shù)研究中心。

  “是時候了,”北京大學生命科學學院教授魏文勝對澎湃新聞(www.thepaper.com)、中國青年報表示,科學家有必要站出來表達看法!疤幚聿缓玫脑挘瑫䥽乐赜绊懼袊茖W家的聲譽!蔽何膭俦硎,他愿意聊聊他所了解的NgAgo。作為國內(nèi)基因編輯領(lǐng)域的領(lǐng)軍人物之一,魏文勝在《Nature》、《Cell》等國際頂級期刊發(fā)表過研究成果。

  不只是魏文勝,總計13位中國生物學家決定實名發(fā)聲。他們還包括:

  北京大學生命科學學院教授魏文勝,北京大學分子醫(yī)學研究所教授熊敬維,北京大學生命科學學院研究員孫育杰,中科院動物研究所研究員王皓毅、李偉,中科院生物物理研究所研究員王曉群,中科院生物化學與細胞生物學研究所研究員李勁松,中科院上海生科院神經(jīng)科學研究所研究員楊輝,浙江大學生命科學研究院教授王立銘,上海交通大學教授吳強,華東師范大學生命科學學院研究員李大力,哈爾濱工業(yè)大學教授黃志偉,溫州醫(yī)科大學教授谷峰。

  他們來自不同的研究細分領(lǐng)域,都在NgAgo誕生伊始跟進重復和驗證,大多耗時兩個月,數(shù)次重復和驗證無一例外的全軍覆沒。

  這13位生物學家一致表示了希望韓春雨能公開所有原始數(shù)據(jù),韓春雨所在河北科技大學及其他相關(guān)單位(如:國家自然科學基金委員會)啟動學術(shù)調(diào)查。

  澎湃新聞分別聯(lián)系了韓春雨、河北科技大學和國家自然科學基金委員會。截至發(fā)稿前,韓春雨、河北科技大學和國家自然科學基金委員會皆未回復澎湃新聞的置評請求。

  驗證和重復結(jié)果:不工作

  所謂基因編輯技術(shù),也就是說NgAgo能對基因進行敲除、插入等改造工作。據(jù)韓春雨在論文中描述,NgAgo在40多個位點保持了可媲美上一代基因編輯技術(shù)CRISPR的高效切割,即21.3%?41.3%的效率。

  科學發(fā)表是文責自負(作者對其發(fā)表文章的真實性承擔全部責任)的。在論文剛發(fā)表時,魏文勝曾正面評價過韓春雨的工作。但意外的是,實驗室4、5個學生經(jīng)過“各種不同的嘗試”,包括重新設(shè)計去調(diào)整優(yōu)化,歷時兩三個月,沒有發(fā)現(xiàn)一個基因出現(xiàn)基因編輯現(xiàn)象,“完全沒有陽性的結(jié)果”。在圈內(nèi)了解其他實驗室的驗證情況后,魏文勝發(fā)現(xiàn)國內(nèi)外這些嘗試過的實驗室無一成功。

  魏文勝向澎湃新聞分析道,面對學術(shù)質(zhì)疑,作者還是有義務(wù)回應的。技術(shù)方法學論文和生物機制研究不同,后者在數(shù)據(jù)解讀方面容易產(chǎn)生歧義,在實驗重復性方面往往需要較長時間的驗證來證明(或者證偽);然而技術(shù)及方法學論文的驗證通常比較直接,當一個方法被報道為高效的方法,那么其可重復性和高效性都必須得到同行證明。在有質(zhì)疑的情況下,當事實驗室通常會積極配合,自我查糾。所屬研究機構(gòu)/學校以及研究資助方也會督促檢查。到目前為止,在國內(nèi)外如此強烈的質(zhì)疑聲中,沒有任何調(diào)查行動,反而當事方頻獲獎勵、榮譽及巨額資助,令人費解。

  韓春雨即使不涉及學術(shù)造假,也已是學術(shù)不端

  魏文勝向澎湃新聞分析道,出現(xiàn)這樣的現(xiàn)象,有3種可能:

  1.NgAgo技術(shù)是高效的基因組編輯技術(shù),但國內(nèi)外至少上百家實驗室的效率為零,唯一可能是相關(guān)課題組隱瞞了關(guān)鍵的實驗步驟;

  2.NgAgo技術(shù)能夠工作,但是效率很低;而國內(nèi)外至少上百家實驗室的嘗試為不工作,則課題組在論文中嚴重夸大了NgAgo的效率;

  3.完全不工作。

  對于第一種情況,隱藏關(guān)鍵實驗步驟意味著什么?魏文勝解釋:“這是嚴重的學術(shù)不端。”

  浙江大學生命科學研究員教授王立銘是2014年的國家“青年千人計劃”,他遇到了相同的問題?吹絅gAgo論文后,他和合作者們懷著激動的心情,開始測試NgAgo方法能否用來定點編輯果蠅胚胎的基因組。果蠅遺傳學研究是王立銘實驗室的專長,王立銘坦言,他和合作者們最初沒有試圖去復盤韓春雨的實驗,因為“基于對科學共同體成員的基本信任,科學同行在分享研究成果時自然會首先默認對方是誠信的、對方的研究成果是真實無誤的。否則一切學術(shù)交流和成果分享都無從談起” 。

  他和合作者們曾經(jīng)成功地使用前三代基因編輯技術(shù)(ZFN,TALEN,和CRISPR/cas9)對大量果蠅基因進行了高效率的編輯。但在被譽為第四代基因編輯技術(shù)NgAgo上,王立銘和合作者們先后在兩個月時間內(nèi),測試了上百種實驗條件,試過不同的基因組位點、基因編輯路徑、成分配比等等,皆無起色!霸谖覀儨y試過的所有條件中,我們都沒有觀察到NgAgo方法對果蠅基因組的編輯活性。”

  中科院動物研究所研究員王皓毅嘗試過完全按照韓春雨論文中的要求進行實驗,“我有兩個學生,獨立地在重復,嚴格地按照他(韓春雨)發(fā)表的細胞系中,使用文章中報道效率較高的三條gDNA進行內(nèi)源基因的編輯,我們也嘗試了去改進(二次轉(zhuǎn)染gDNA、延長培養(yǎng)時間等),但沒有陽性結(jié)果。所以我們也就不想再在這上面浪費時間了!

  NgAgo或許不具備雙鏈DNA切割活性

  此前,在分析NgAgo技術(shù)為何出現(xiàn)大面積無法重復時,曾有業(yè)內(nèi)人士從科學角度分析,韓春雨論文中稱NgAgo可引發(fā)宿主染色體靶向位點的DNA雙鏈斷裂,這或許缺乏實施依據(jù)和理論依據(jù)。

  哈爾濱工業(yè)大學教授黃志偉從事結(jié)構(gòu)生物學方向的研究,他對通過NgAgo“編輯”的200個左右的克隆進行了測序,僅發(fā)現(xiàn)有幾個克隆有點突變,并沒有看到基因敲除和插入。黃志偉說,NgAgo是韓春雨通過Ttago基因催化位點的保守性找到的,如果把保守催化位點氨基酸突變掉,NgAgo應該沒有活性。但黃志偉告訴澎湃新聞,韓春雨曾“親口”告訴他,“NgAgo突變體還有活性”。黃志偉認為“這也很不合乎常理”。這也說明NgAgo的所謂“活性”或許不是來自于它本身。黃志偉認為,這也可能解釋了韓春雨文章中,沒有突變體或者沒有不加NgAgo對照實驗的原因。

  北京大學生物動態(tài)光學成像中心研究員孫育杰的實驗室專長熒光成像,近來一直致力于發(fā)展和使用基于CRISPR和TALEN等基因編輯技術(shù)實現(xiàn)染色質(zhì)DNA的熒光標記,相關(guān)成果已經(jīng)發(fā)表。在韓春雨論文發(fā)表后,孫育杰實驗室也跟進了。在向澎湃新聞描述他的跟進結(jié)果時,孫育杰表示,自己所在的實驗室嘗試用NgAgo去切割兩個內(nèi)源基因以及整合在基因組的gfp基因,都沒有做出來。

  更重要的是,作為其實驗室最在行的熒光成像,也就是用NgAgo去做基因位點標記時,他們發(fā)現(xiàn)用NgAgo無法標出端粒,這意味著“NgAgo未必有結(jié)合和打開雙鏈DNA的能力”。

  孫育杰進一步解釋:端粒有一個特點,它有數(shù)千個重復片段,如果用CRISPR或者TALEN這樣的技術(shù)去target(靶向)端粒的重復片段的話,由于它有上千次重復,數(shù)百、上千個CRISPR或TALE會富集在那些位點,所以在熒光顯微鏡下一眼就看見了,并且這一結(jié)果在世界上多個實驗室都已重復出來并發(fā)表在多篇文章中,F(xiàn)在對端粒設(shè)計NgAgo,我們看不到它上去!拔覀冞@個實驗,基本上可以推測出NgAgo沒有結(jié)合雙鏈DNA的能力!睂O育杰說。

[責任編輯:張曉靜]