9月1日 達(dá)賴訪臺(tái)嚴(yán)重沖擊兩岸關(guān)系，原定多項(xiàng)交流活動(dòng)取消。
福建實(shí)行臺(tái)灣居民入境預(yù)受理,方便臺(tái)胞通關(guān)。
9月3日 廣西頒布《關(guān)于支持臺(tái)資企業(yè)發(fā)展的若干政策措施》。
9月4日 兩岸證券投資論壇舉行，業(yè)者稱各具優(yōu)勢(shì)具互補(bǔ)空間。
兩岸合出《康熙朝起居注冊(cè)》，還原真實(shí)清史資料。
9月6日 首條大陸船公司開(kāi)通的“廈門(mén)－臺(tái)中”客滾直航航線正式開(kāi)啟。
第五屆海峽旅游博覽會(huì)開(kāi)幕,兩岸旅游界共商合作。
9月7日 臺(tái)灣中華兩岸旅游產(chǎn)業(yè)發(fā)展協(xié)會(huì)和福建師范大學(xué)在廈門(mén)簽訂《閩臺(tái)旅游產(chǎn)學(xué)發(fā)展合作協(xié)議》，進(jìn)一步推進(jìn)兩岸教育資源共享及兩岸旅游人才培養(yǎng)。
首個(gè)兩岸直航客船與搜救中心合作計(jì)劃在廈門(mén)啟動(dòng)。
海峽兩岸簽署首份檢驗(yàn)檢疫合作備忘錄。
以“海峽旅游，合作共贏”為主題的第五屆海峽旅游博覽會(huì)在廈門(mén)正式開(kāi)館。
9月9日 中國(guó)金融學(xué)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)、中國(guó)人民銀行副行長(zhǎng)蘇寧率大陸金融代表團(tuán)抵臺(tái)參訪。
大陸首家臺(tái)商獨(dú)資產(chǎn)險(xiǎn)機(jī)構(gòu)獲保監(jiān)會(huì)批準(zhǔn)。
9月10日 中國(guó)紅十字會(huì)總會(huì)代表團(tuán)赴臺(tái)灣災(zāi)區(qū)慰問(wèn)。中國(guó)紅十字會(huì)做出計(jì)劃，擬安排1億元人民幣的社會(huì)捐款與臺(tái)灣紅十字組織合作，共同參與臺(tái)灣災(zāi)后重建項(xiàng)目，幫助臺(tái)灣受災(zāi)同胞早日恢復(fù)正常生活。
福建先行先試推進(jìn)海峽兩岸司法交流和協(xié)作互助。
9月11日 中國(guó)紅十字會(huì)進(jìn)入高雄縣重災(zāi)區(qū)了解災(zāi)情慰問(wèn)災(zāi)民。
9月12日 臺(tái)計(jì)劃放寬在港澳工作內(nèi)地居民赴臺(tái)游條件。
臺(tái)灣少數(shù)民族團(tuán)體向?yàn)?zāi)民發(fā)放大陸2000萬(wàn)專項(xiàng)捐款。
大陸公安機(jī)關(guān)破獲兩岸不法分子系列電信詐騙案。
9月14日 中國(guó)紅十字會(huì)總會(huì)代表團(tuán)一行結(jié)束在臺(tái)行程返回大陸。中國(guó)紅十字會(huì)總會(huì)常務(wù)副會(huì)長(zhǎng)江亦曼離臺(tái)前接受新華社記者采訪時(shí)表示，這是大陸紅十字組織首次深入臺(tái)灣災(zāi)區(qū)考察災(zāi)情，中國(guó)紅十字會(huì)總會(huì)將與臺(tái)灣紅十字組織一道，共同商定援建項(xiàng)目。
9月16日 大陸八家航空公司赴臺(tái)投資案全獲通過(guò)。
浙江出臺(tái)29條意見(jiàn)幫助臺(tái)資企業(yè)渡難關(guān)。
福建首次成批次大規(guī)模組織高校學(xué)生赴臺(tái)學(xué)習(xí)。
9月17日 中華臺(tái)北籃協(xié)決議開(kāi)放球員赴大陸打球。
9月20日 國(guó)臺(tái)辦就高雄市決定播放熱比婭影片一事發(fā)表談話。
中國(guó)國(guó)務(wù)院臺(tái)辦主任王毅在南昌出席“二00九贛臺(tái)(南昌)經(jīng)貿(mào)研討會(huì)”活動(dòng)，會(huì)見(jiàn)了到會(huì)的中國(guó)國(guó)民黨副主席蔣孝嚴(yán)、新黨主席郁慕明等到會(huì)臺(tái)灣嘉賓。
9月21日 “2009贛臺(tái)經(jīng)貿(mào)合作研討會(huì)”簽約資金逾14億美元。
“輝煌六十年——中華人民共和國(guó)成立六十周年成就展”二十一日繼續(xù)對(duì)公眾開(kāi)放。其中，專題展的第十一單元，用大量文獻(xiàn)、圖片和視頻等多媒體技術(shù)，全面介紹兩岸關(guān)系發(fā)展取得的歷史性成就。
大陸少數(shù)民族交流團(tuán)赴臺(tái)展開(kāi)賑災(zāi)義演。
9月22日 第14屆海峽兩岸影視文化交流與合作座談會(huì)在臺(tái)舉行。
分別60年來(lái)首次團(tuán)圓,北京故宮文物即將赴臺(tái)“尋親”。
9月23日 中國(guó)國(guó)民黨主席吳伯雄2在臺(tái)北會(huì)見(jiàn)了以國(guó)家民委副主任楊健強(qiáng)為總顧問(wèn)的大陸少數(shù)民族大學(xué)生文化交流團(tuán)一行。
臺(tái)灣海基會(huì)董事長(zhǎng)江丙坤表示，根據(jù)大陸統(tǒng)計(jì)，各界對(duì)臺(tái)灣風(fēng)災(zāi)的捐款，實(shí)際入帳和已同意捐款金額可能高達(dá)人民幣9.6億元(約新臺(tái)幣45億元)，是大陸最大規(guī)模的援助行動(dòng)。
廈金海底直達(dá)光纜建設(shè)已著手勘察設(shè)計(jì)。
9月25日 在臺(tái)灣發(fā)生“莫拉克”風(fēng)災(zāi)后，于8月下旬赴臺(tái)實(shí)地組裝并指導(dǎo)臺(tái)方相關(guān)人員的10名大陸活動(dòng)板房技術(shù)人員圓滿完成工作，離臺(tái)返鄉(xiāng)。
9月26日 兩岸鄉(xiāng)親廈門(mén)同祭孔，金門(mén)縣長(zhǎng)李炷烽等跨海參加。
9月27日 2009第二屆兩岸師生聯(lián)合祭孔大典在新竹舉行。
9月28日 臺(tái)盟中央、全國(guó)臺(tái)聯(lián)在京舉辦建國(guó)60周年國(guó)慶招待會(huì)。
兩岸依協(xié)議共同打擊犯罪,首采直航模式遣返人犯。
大陸臺(tái)生會(huì)就大陸學(xué)歷采認(rèn)提“四正一沒(méi)有”。
240名參與國(guó)慶觀禮臺(tái)胞抵京組全國(guó)臺(tái)聯(lián)觀禮團(tuán)。
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